Начиная с версии PHPShop Enterprise 2.1.8.2.0, реализована возможность размещение 2-х и более независимых интернет-магазинов в любых директориях домена. Данная особенность позволяет создавать многоязычные проекты и гиппермаркеты, используя 1 лицензию.

Для задания папки размещения требуется выполнить всего несколько шагов:

1. копируем скрипт в любую директорию, например /free/
2. библиотеку //phpshop/lib/ копируем в корень /
3. в файле конфигурации /free//phpshop/inc/config.ini указываем имя директории, куда установлен скрипт

[dir]
dir="/free"; 

4. магазин запуcкается и работает независимо от остальных из папки /free/

Таким образом, можно установить неограниченное кол-во интернет-магазинов на одном домене.
Поддерживается возможность установки нескольких магазинов в единую базу, для этого служит опция префикс в названиях таблиц:
phpshop_   - 1 магазин
phpshop2_ - 2 и т.д.
Тип префикса задается в файле config.ini